In der Orthodoxie sind die ökumenischen Konzile die höchste institutionelle Entscheidungs-Instanz. Allerdings gelten sie nicht als per se unfehlbar, denn mehrmals wurde Konzilen, die sich selbst als "ökumenisch" genannt hatten, dieser Status später von einem anderen Konzil aberkannt, zu dem Beispiel wegen mangelnder Zustimmung in der christlichen Bevölkerung. Ca. die Kirche als ganzes gilt als unfehlbar, wobei offenbleibt, in welchen Personen, Institutionen, Gremien, oder Bewegungen sich diese Unfehlbarkeit jeweils äußert, denn: "Der Geist weht, wo er will."

Im Katholizismus ist das entscheidende Kriterium dafür, ob ein Konzil ökumenisch ist oder nicht, seine Leitung durch den Papst oder seine Beauftragten, sowie die Zustimmung des Papstes zu seinen Beschlüssen.

Bei den Evangelischen Kirchen werden zwar die Ergebnisse der Konzile größtenteils akzeptiert, allerdings gilt laut Luther: "Auch Konzile können irren". Ihnen ist stets dann zuzustimmen, wenn ihre Lehre in dem Einklang mit der Bibel steht. Andernfalls ist kein Christ verpflichtet, sie anzuerkennen. Probleme treten häufig bei der Anerkennung des siebenten Konzil auf.

Die ersten beiden ökumenischen Konzile (erstes Konzil von Nicäa und erstes Konzil von Konstantinopel) werden von nahezu allen christlichen Kirchen anerkannt.

Nach Abspaltung der Monophysitischen Kirchen und der Assyrischen Kirche des Ostens wurden die folgenden fünf Konzile von der Reichskirche anerkannt. Damit erkennen auch die heute orthodoxen, katholischen und die meisten evangelischen Kirchen die insgesamt sieben ökumenischen Konzile an; beim siebten Konzil gibt es jedoch große Vorbehalte evangelischerseits.

In der orthodoxen Kirche werden von manchen auch das pro-Photius-Konzil von 879 und das palamitische Konzil von 1351 als ökumenische Konzilien anerkannt; die meisten nennen diese Konzile lediglich als panorthodox, also alle orthodoxen Kirchen betreffend.

Die Tendenz, die eigene Theologie als die alleinige Wahrheit wahrzunehmen und damit den Anspruch zu verknüpfen, die einzige wahre Kirche zu vertreten, führte dazu, dass in späterer Zeit einzelne christliche Konfessionen ihrerseits Ökumenische Konzile einberiefen.